分子蒸餾的條件是：
1、殘余氣體的分壓必須很低，使殘余氣體的平均自由程長度是蒸餾器和冷凝器表面之間距離的倍數。
2、在飽和壓力下，蒸汽分子的平均自由程長度必須與蒸發器和冷凝器表面之間距離具有相同的數量級。
在這此理想的條件下，蒸發在沒有任何障礙的情況下從殘余氣體分子中發生。所有蒸汽分子在沒有遇到其它分子和返回到液體過程中到達冷凝器表面。蒸發速度在所處的溫度下達到可能的最大值。蒸發速度與壓力成正比，因而，分子蒸餾的餾出液量相對比較小。
在SY短程蒸餾中，冷凝器和加熱表面之間的距離約為20~50mm，殘余氣體的壓力為10-3mbar時，殘余氣體分子的平均自由程長度約為2倍長。短程蒸餾器完全能滿足分子蒸餾的所有必要條件。
分子蒸餾有如下特點：
1、普通蒸餾在沸點溫度下進行分離，分子蒸餾可以在任何溫度下進行，只要冷熱兩面間存在著溫度差，就能達到分離目點。
2、普通蒸餾是蒸發與冷凝的可逆過程，液相和氣相間可以形成相平衡狀態；而分子蒸餾過程中，從蒸發表面逸出的分子直接飛射到冷凝面上，中間不與其它分子發生碰撞，理論上沒有返回蒸發面的可能性，所以，分子蒸餾過程是不可逆的。
3、普通蒸餾有鼓泡、沸騰現象；分子蒸餾過程是液層表面上的自由蒸發，沒有鼓泡現象。
4、表示普通蒸餾分離能力的分離因素與組元的蒸汽壓之比有關，表示分子蒸餾分離能力的分離因素則與組元的蒸汽壓和分子量之比有關，并可由相對蒸發速度求出。
 
裝置特性
高沸點物劑 
使用專用的金屬部件，能處理沸點達450℃的物料在真空0.001mbar條件下。
粘性和容納有固體物料 
浸入液膜的刮片產生強烈的剪切力，能相當可觀地減輕混合液的粘度，因此，可處理粘度達50Pas的物料。
固體含量富余料 
浸入液膜的刮片產生一個強烈的攪拌力，同樣能防止固體在加熱面上結垢。
裝置特性
 
顏色敏感物料 
在SY型短程蒸餾器中，本公司專業設計有一種裝置能防止金屬磨損。這一裝置非常重要，萬一處理顏色敏感物料因非揮發物（重組分）流經蒸餾器由于金屬磨損而受到影響。
高蒸餾比 
使用制作精密的刮膜片，意味著液膜能被均勻地涂沫在加熱面并使整個受熱面濕潤，這就能滿足高蒸餾比的要求，使得90%以上產品被蒸餾，維持恒量的殘留物。
低維修費用 
由于合理的結構設計和獨特的轉子，避免了刮膜片和金屬表面的磨損。